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基因疗法新拼图:算法揭示 188 种新型 CRISPR 系统

2023-11-25 14:10:47来源: IT之家

IT之家 11 月 25 日消息,科学家近日开发出新算法,在数十亿个蛋白质序列中,成功发现 188 个罕见且以前未知的 CRISPR 连接基因模块,为利用 CRISPR 系统和了解微生物蛋白质的功能多样性提供了新见解。图源:Carlos Clarivan / Science Photo Library该项目由 CRISPR 技术先驱张锋教授带领,团队成员来自麻省理工学院麦戈文脑研究所、麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所以及美国国立卫生研究院国家生物技术信息中心(NCBI)等,相关成果于 11 月 23 日发表在《Science》期刊上。团队开发出新的搜索算法--基于快速局部敏感哈希聚类算法(FLSHclust),使用该算法深入挖掘三个主要的公共数据库,从中识别出了 188 种新型 CRISPR 系统,并对其中 4 个系统进行了详细表征。这些新系统可能被用来编辑哺乳动物细胞,其脱靶效应比目前的 CRISPR-Cas9 系

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