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哈佛与牛津开发基因致病性预测模型,现已成功预测 3600 万个致命基因突变

2021-10-28 16:43:57来源: IT之家

直接从基因层面预测疾病,这一直是近现代医学研究的主要方向之一。然而,全体人类的基因变异体数量远超现有的探测技术,甚至仅仅是不同个体的蛋白质区编码也会展现出巨大的差异性。因此,超过 98% 的基因变异给人体带来的影响依旧是未知且无法预测的。但最近,来自哈佛医学院和牛津大学的科学家合作开发了一种 AI 模型,成功预测了 3219 个疾病基因中超过 3600 万个变体的致病性,并将超过 25 万个未知变体进行了归类。这项研究现已登上 Nature。“从进化中预测致病性”其实,现在临床上已有用于预测基因变异影响的模型。但这些模型往往是在经过标注的临床数据集上进行有监督学习,一旦进入现实场景,标签偏差、标签稀疏以及噪音就会造成其准确率的下降,并不能作为基因变异体分类的可靠依据。而这次的研究团队提出了一个叫做 EVE(Evolutionary model of Variant Effect)的模型。这是一个仅根据进化序列训练的无监督生成模型

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